Pas toujours simple de gérer seul une micro-entreprise ! Tous les indépendants vous le diront, il est essentiel de s’appuyer sur des logiciels fiables et bien pensés pour se faciliter la vie. Qu’il s’agisse de la gestion de projet, de la relation client, du marketing, voire de la partie comptabilité, toutes les tâches du quotidien peuvent gagner à la fois en simplicité et en efficacité si l’on choisit le bon outil.
Pour vous guider dans la quantité de solutions disponibles sur le marché, nous avons fait une sélection des meilleurs logiciels recommandés en micro-entreprise. La voici !
Les outils de cet article ont été sélectionnés par notre équipe et ne sont pas sponsorisés. Découvrez comment sponsoriser votre outil.
Les 5 meilleurs logiciels de micro-entreprise pour créer des factures
Très pratiques pour la création et la gestion de documents comptables dans les règles de l’art, il existe un grand choix de logiciels destinés à faciliter la facturation en micro-entreprise. Voici nos préférés.
Abby

Abby, c’est l’outil qu’il vous faut si vous cherchez à centraliser facturation, comptabilité et suivi TVA sans jongler entre trois plateformes différentes. Le logiciel automatise ce qui prend du temps : synchronisation bancaire, catégorisation automatique des dépenses, génération des déclarations TVA. Plus besoin de tout faire à la main.
Côté facturation ? Vous créez vos documents conformes à la loi anti-fraude, à la facturation électronique et surtout, vous programmez des relances automatiques pour récupérer vos impayés.
Que vous soyez développeur, designer ou consultant, l’interface s’adapte à votre activité de freelance sans vous imposer des fonctionnalités dont vous n’avez pas besoin.
C’est une solution complète qui demande un peu plus de prise en main que des outils ultra-simples. Mais si vous voulez consolider votre gestion administrative en un seul endroit, ça vaut le coup d’y jeter un œil.
Facture.net
Logiciel de comptabilité entièrement gratuit et en ligne, Facture.net est un support indispensable pour les petites entreprises. Il simplifie grandement la gestion commerciale, d’abord par la création de factures et de devis répondant parfaitement aux normes. Le dashboard est également un excellent moyen de suivre son chiffre d’affaires et de gérer ses clients au fil des missions.
Points forts :
- 100% gratuit et en ligne
- Compatible facturation électronique
- Très complet : devis et factures, CRM, site vitrine, prise de rendez-vous.
Magniv Pro
L’entreprise française Magniv Pro met l’accent sur la simplicité de son outil de facturation et de devis. On peut générer les documents, les transmettre directement aux clients, y compris avec un lien de paiement en ligne. Ensuite, le tableau de bord permet de garder un œil sur le règlement des factures. Le tarif du logiciel dépend des montants facturés par la micro-entreprise.
Points forts :
- Création et envoi rapide des factures
- Tableau de bord clair
Shine Facture
Gratuit dans sa version de base, Shine Facture accompagne les indépendants dans la création rapide de factures. En peu de clics, après avoir ouvert un compte sur la plateforme, on peut générer des factures conformes à la loi ainsi que des devis. On s’aide pour cela d’une interface qui plaît par sa simplicité d’utilisation et son caractère intuitif.
Points forts :
- Interface intuitive
- Comptabilité facture électronique
Henrri
Sur le marché depuis une dizaine d’années, Henrri est parfait pour créer des devis, d’autant que c’est un logiciel collaboratif : ses fonctionnalités incluent la possibilité d’intervenir à plusieurs sur les documents. Très intuitif, c’est également un outil de facturation précieux pour les micro-entreprises.
Points forts :
- Facturation collaborative
- Intuitif et complet
Les 5 meilleures solutions pour créer sa micro-entreprise
Créer sa micro entreprise n’a rien de bien sorcier, mais vous pouvez tout de même vous faire aider dans vos démarches gratuitement.
Qonto
Solution tout-en-un pour créer rapidement sa micro-entreprise, Qonto vous propose également un compte bancaire et une carte physique ou virtuelle. Si le compte bancaire dédié n’est pas obligatoire en micro-entreprise, il reste fortement conseillé. Côté création de votre micro-entreprise, l’interface est simple et propose un suivi en temps réel de toutes les démarches.
Legalstart
Legalstart est une plateforme juridique en ligne qui guide pas à pas dans la création d’une micro-entreprise, le tout sans se déplacer. Idéal pour gagner du temps et sécuriser ses démarches. Créer une micro-entreprise est simple. Ça l’est encore plus avec Legalstart.
Points forts :
- Guidage pas à pas
- Gain de temps
Swapn
Solution dédiée aux freelances et micro-entrepreneurs pour automatiser la création de leur entreprise. Simple et rapide, Swapn s’occupe des formalités administratives et propose des outils de gestion financière intégrés.
Points forts :
- Automatisation des formalités
- Outils financiers intégrés
Dougs
Expert-comptable en ligne qui combine création d’entreprise et gestion comptable. Dougs permet de créer sa micro-entreprise et de gérer sa comptabilité depuis une seule interface intuitive, avec conseils personnalisés.
Points forts :
- Expert-comptable en ligne
- Conseils personnalisés
Shine
Shine est une néobanque pensée pour les indépendants et micro-entrepreneurs. Parmi ses service, Shine propose la création de votre micro-entreprise en ligne, le compte pro connecté, la facturation intégrée et l’assistance juridique et administrative pour démarrer sereinement son activité.
Points forts :
- Néobanque pour indépendants
- Accompagnement complet
Les 5 meilleurs CRM pour votre micro-entreprise
Autre soutien extrêmement utile quand on gère une activité professionnelle : le logiciel de relation client, autrement dit CRM. Plus ou moins développées par le biais de diverses fonctionnalités possibles, ces plateformes se révèlent très précieuses pour la gestion des clients et des prospects d’une micro-entreprise.
Dolibarr

Le logiciel open source Dolibarr n’est pas qu’un CRM : c’est aussi un ERP destiné à gérer toutes les activités d’une entreprise. Cette suite web tout-en-un est pensée pour répondre aux besoins des professionnels en misant plus sur la praticité des fonctionnalités que sur le design. C’est un CRM gratuit dans sa version de base, mais proposant aussi des plugins pour l’enrichir de nombreuses options.
Points forts :
- Open-source et gratuit
- Suite complète ERP + CRM
Brevo
Brevo est à la pointe du marketing automation, c’est-à-dire qu’il met à disposition des professionnels l’automatisation de certains processus chronophages dans le but de renforcer leur activité. Ce CRM offre une approche multicanale de la relation client. Avec cet outil, les micro-entreprises peuvent gérer leurs échanges via e-mail, sms/WhatsApp ou chat. Il peut, en plus de cela, être connecté à plus de 150 outils, dont WordPress, PrestaShop ou encore MailChimp.
Points forts :
- Marketing automation multicanal
- Connexion à 150+ outils
SuiteCRM
Si SuiteCRM a beaucoup de succès auprès des micro-entrepreneurs, c’est que ce logiciel CRM est très complet. Target lists, prospection personnalisée, contacts, reporting : toute la gestion de la micro-entreprise peut s’y retrouver. Très claire, son interface couvre toute l’activité de l’entreprise et réunit en un clin d’œil l’ensemble des clients. Sa version gratuite est déjà très bien faite et il existe des extensions payantes pour débloquer toute une panoplie de fonctionnalités.
Points forts :
- Gestion complète des clients et prospects
- Extensions disponibles
Crème CRM
Crème CRM est un logiciel entièrement gratuit et très complet pour la gestion de la clientèle d’une micro-entreprise, et bien plus encore. Il peut être utilisé par un prestataire pour s’y retrouver dans ses ventes et ses clients, mais se transforme aussi un outil marketing au besoin. Les statistiques commerciales sont mises à jour en temps réel, l’agenda est fonctionnel et doublé d’alertes. Crème CRM est un outil open source parmi les plus performant et modulables qui existent.
Points forts :
- Open source et modulable
- Statistiques et alertes en temps réel
Vtiger
Logiciel performant, Vtiger a l’avantage de faciliter l’intégration d’autres outils. Cela permet au professionnel d’avoir une vision à 360° de son activité en mêlant commercial et marketing. On accède facilement au suivi des contrats et aux statistiques de la micro-entreprise, on peut aussi automatiser certaines tâches. Une première version gratuite est accessible à tous et d’autres sont proposées avec des fonctionnalités supplémentaires payantes.
Points forts :
- Vision 360º de l’activité
- Automatisation des tâches
Les 5 meilleurs logiciels de micro-entreprise pour la gestion de projet
Les outils de gestion de projet sont essentiels pour simplifier le quotidien des professionnels. En micro-entreprise, on apprécie ces logiciels aussi car ils servent à booster la productivité.
Trello

Trello est la star des logiciels de gestion de projet ! Son interface est très intuitive, ce qui rend l’organisation quotidienne des tâches soudain beaucoup plus agréable. On crée des tableaux, que l’on répartit sous forme de listes et de « cartes » selon son besoin, en y intégrant toutes les infos indispensables. Parfaitement modulable et pourtant gratuit, Trello s’utilise seul ou à plusieurs.
Points forts :
- Suivi clair des échéances et tâches
- Collaboratif et modulable
Asana
Outil collaboratif de gestion de projet, Asana est pensé pour organiser le travail d’une équipe ou de travailleurs indépendants. Des petites aux grandes missions qui rythment le quotidien d’une micro-entreprise, Asana permet de tout centraliser et d’assurer le suivi des échéances à respecter. On l’apprécie pour son ergonomie et sa facilité d’usage.
Points forts :
- Centralisation des missions
- Ergonomie adaptée
Notion
Notion est une très bonne alternative pour la gestion de projet, particulièrement en équipe car les modules sont collaboratifs. La particularité de cet outil en ligne est qu’il intègre une assistance IA pour tout ce qui concerne la rédaction, la révision et la traduction de textes. Mis à part cela, il sert à créer des documents sous de multiples formes et à organiser les missions par le biais d’un tableau de bord très clair.
Points forts :
- Polyvalent
- Assistant IA intégré
ClickUp
Autre solution de gestion de projet, ClickUp est également à la pointe en termes de travail collaboratif. Le dashboard (proposé en 15 vues différentes) ressence les différentes tâches en cours et chacune peut être attribuée à un partenaire selon le besoin. ClickUp est très personnalisable et s’appuie aussi sur un assistant IA, entre autres outils. Par le biais de ses différentes fonctionnalités, la plateforme accompagne un gain de productivité et une optimisation du travail.
Points forts :
- Dashboards personnalisables
- Fonctions collaboratives et IA
Wrike
Un micro-entrepreneur appréciera la gestion de projet et l’organisation des tâches à réaliser que permet Wrike. C’est en réalité un outil bien plus vaste que cela, puisqu’il couvre aussi, par exemple, la gestion de campagnes marketing. En facilitant la collaboration en équipe et en intégrant de l’IA dans ses fonctionnalités, Wrike se présente comme un logiciel agile et très performant.
Points forts :
- Gestion de projet + marketing
- Outils collaboratifs avancés
Les 5 meilleurs logiciels pour la communication de votre micro-entreprise
Une activité professionnelle quelle qu’elle soit a besoin de se faire connaître. Il existe là aussi de nombreux logiciels permettant aux micro-entreprises de gagner en visibilité, qu’il s’agisse de création graphique, de campagnes marketing, de stratégie réseaux sociaux.
Canva

Si vous avez l’âme créative mais n’avez pas de compétences en graphisme, Canva est l’outil fait pour vous ! Cette plateforme a été spécialement conçue pour permettre à chacun de créer des contenus graphiques en quelques clics. On y trouve une multitude de modèles adaptés à différents supports (sites web, réseaux sociaux, plaquettes…), que l’on peut facilement personnaliser.
Indispensable pour se créer une identité visuelle, le logiciel dispose d’une version gratuite et de fonctionnalités payantes. L’abonnement permet même d’inviter des collaborateurs sur un projet.
Points forts :
- Création graphique facile
- Collaboration sur les design
Hootsuite
Hootsuite est l’outil de gestion de réseaux sociaux le plus connu. Il permet d’avoir une vision globale des différentes plateformes social media de la micro-entreprise et de ses clients. Création de contenu optimisée, programmation, mais aussi analyse des campagnes : tout est centralisé au départ d’un seul tableau de bord. Par ailleurs, l’utilisateur est guidé vers les meilleures pratiques et peut ainsi améliorer ses réalisations, avec pour finalité l’amélioration de sa portée, de son engagement et du RSI.
Points forts :
- Gestion multiréseaux
- Analyse et optimisation
Mailchimp
Leader de l’emailing marketing, Mailchimp est un allié précieux pour bon nombre de micro-entreprises. Cette plateforme de grande qualité est pensée pour gérer ses contacts de manière efficace et pour créer des newsletters sur la base de nombreux templates modulables. On peut ensuite suivre les statistiques de chaque campagne. Mailchimp existe en version gratuite et payante.
Points forts :
- Templates modulables
- Personnalisation des campagnes marketing
WordPress
WordPress est le plus connu des créateurs de site web et de blogs. La très grande quantité de thèmes disponibles en fait un outil parfait pour apporter de la visibilité à son activité en tant que micro-entreprise. Le CMS est facile à utiliser, à la portée de tous. WordPress est accessible gratuitement, même s’il existe des plans payants proposant des options pour développer son site et sa visibilité.
Points forts :
- Nombreux thèmes disponibles
- Accessible même pour les débutants
Zapier
Le logiciel en ligne Zapier est pensé pour l’automatisation des tâches répétitives et chronophages que l’on peut connaître dans le quotidien d’une micro-entreprise. C’est un service qui s’utilise facilement et qui permet d’intégrer de nombreuses applications de pointe pour automatiser ce qui est le plus utile pour chaque professionnel. Le but est d’améliorer le workflow et de gagner en confort mais aussi en visibilité, ce qui en fait un des meilleurs logiciels pour micro-entreprise.
Points forts :
- Automatisation des tâches répétitives
- Intégration de multiples outils
Le choix de logiciel micro-entreprise
Gérer une micro-entreprise seul n’est pas toujours simple, mais bien s’équiper peut transformer votre quotidien. Facturation, CRM, gestion de projet, communication… les bons logiciels vous font gagner du temps, de l’efficacité et surtout de la sérénité.
Pour débuter, identifiez vos besoins prioritaires et testez quelques outils gratuits : Facture.net pour vos factures, Trello ou Notion pour organiser vos projets, et Canva pour votre communication visuelle.
Petit à petit, vous trouverez la combinaison d’outils qui vous correspond parfaitement et qui fera passer votre micro-entreprise à la vitesse supérieure.
N’oubliez pas : un logiciel n’est utile que si vous l’utilisez pleinement. Alors choisissez intelligemment, testez, et laissez-les simplifier votre quotidien pour vous concentrer sur ce que vous faites de mieux : développer votre activité.




